本中心建立「前瞻菌種鑑定技術與產業服務」之核心內容包括:
1. 應用微生物條碼技術構建我國最大微生物鑑定序列資料庫
挑選各類微生物具鑑別性基因片段進行序列解碼,與國際各大序列資料庫進行比對,確定可信菌名,收錄並建構我國自有微生物鑑定條碼資料庫,已完成兩千七百多種,共八千六百餘筆微生物鑑定序列資料,為我國最大微生物鑑定序列資料庫,可提供後續菌種序列鑑定比對,鑑定產業用菌株,提高菌種正確性。
2. 導入前瞻蛋白質指紋鑑定技術滿足產業快速鑑定微生物需求
將已正確鑑定菌種進行培養,並以標準化程序進行全細胞蛋白質萃取,進行質譜分析,獲得圖譜資訊以做為蛋白質指紋資料,已建構符合台灣食品與生技產業使用的菌種蛋白質指紋圖資料庫計835株,可快速鑑定微生物種類,協助相關產業包括應用於微生物產品之品質追蹤與追溯,強化製程品保。協助生技藥廠改善製程環境的微生物控制及汙染之風險監測,以符合國際PIC/S GMP查驗要求;對於開發具特殊保健功效、安全發酵食品或生技醫藥產品所需潛力生產菌株的篩選,亦可提供快速、準確的資訊來縮短產品開發時程,並大幅減少檢測費用
3. 多重基因序列分析技術開發商用菌種產品鑑別利器
利用多重基因座序列分析,鑑別相近菌株差異可作為產業專利菌株或生產菌株之身分鑑別條碼,加強菌株之保護,並能符合國外行銷或健康食品查驗登記法規要求。利用比較相似菌株之多段鑑別基因序列差異,針對同種菌株間進行分型,已開發商用菌種產品分子分型鑑別技術,建立重要產業菌株之多重基因座序列分型(MLST)資料庫。藉由分型技術與資料庫之建立可協助解決菌種查驗登記等適法性問題,如健康食品查驗登記、專利菌株申請及生產菌株之身分鑑別,加強菌株之保護及符合法規要求。
4. 運用基因體科技提供菌株基因差異及安全評估之科學佐證
建立具科學性的風險程度評估方法與數據,提供菌株安全性的佐證資料或對具危害風險因子的生產菌株提供較安全菌株的取代方案,以協助有價值產品能繼續於市面上流通。運用基因體資通技術分析抗生素抗性基因移轉之潛在風險,提供菌株基因差異及安全評估分析,解決廠商出口問題。此外,提出科學數據積極與公部門溝通使其在制定政策或在政策宣導上理解益生菌的合理差異與正確使用限制,以解決廠商面臨法規制度下的痛點。